GEO数据库运用

   刊发时间:2021-09-07 06:35:04   来源:火狐体育官方投注 作者:火狐体育注册网址

  GEO数据库运用 GEO Introduction GEO: GSM(样本编号), GLP(检 测渠道), GSE(基因数据成果) Loading GEO dataset GSE41804_family GSE41804_series_matrix 基因表达的剖析 确认要剖析的基因,列出该基因mRNA的NCBI标记号如 NM_101523,有的基因有多个转录本,可能有多个mRNA 标记号。 在下载的GEO数据库family.soft表中查找该基因的标记号 确认该基因对应的基因芯片号。 用该基因芯片号在GEO数据库series_matix表中查找该芯 片号对应的一切样本的荧光信号值即基因表达值。剖析不 同样本中该基因的表达差异。 依据样本数据确认该基因的高表达组和低表达组,进行相 应的数据剖析。 进行多个基因的表达相关性剖析。

 

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